Kurumun Yönetim Kurulu, Bakanlar Kurulu tarafından üç yıl için atanır ve Başkan, Başkan Yardımcısı ve beş üyeden oluşur. Beş üye, Temsilciler Meclisi’nde temsil edilen siyasi partilerin Gençlik örgütlerinin temsilcileridir. Üyelerin geri kalanı doğrudan Bakanlar Kurulu tarafından atanır. Gençlik Kurulu ile Bakanlar Kurulu arasındaki irtibat, Eğitim ve Kültür Bakanıdır.